وكان رئيس الجمهورية الدكتور محمد مرسى هو مجموعة من قيادات جماعة الأخوان المسلمين أمثال الدكتور عصام العريان مستشار رئيس الجمهورية السابق وعضو مجلس الشورى الحالى بالتعيين والدكتور سعد الكتاتنى رئيس مجلس الشعب المنحل ورئيس حزب الحرية العدالة الحالى وسعد الحسينى محافظ كفر الشيخ قد قاموا بالهروب من داخل سجن وادى النطرون فى يوم الثامن والعشرون من يناير والمعروف بجمعة الغضب أثناء اندلاع ثورة الخامس والعشرون من يناير وقد تم اقتحام كافة السجون فى ذلك الوقت على مستوى جميع المحافظات المصرية .
وقد أكد من قبل اللواء عصام القوصى مأمور سجن ليمان 430 وادى النطرون الذى كان يتواجد به السيد الرئيس الدكتور محمد مرسى خلال شهادته أمام أمام محاكمة أحد الهاربين من السجن فى ذلك الوقت بأنه قد قامت مجموعة كبيرة من الجماعات المسلحة والمدربة باقتحام كافة السجون السياسية على مستوى الجمهورية التى كان يتواجد بها الرئيس محمد مرسى والدكتور عصام العريان والدكتور سعد الكتاتنى وقيادات أخرى من داخل الجماعة وقامت بتهريبهم جميعا من داخل اسوار السجون بعد إقتحامها ,
وعلى خلفية هروب الرئيس محمد مرسى من داخل سجن وادى النطرون أكد المستشار مرتضى منصور رئيس نادى الزمالك السابق والمحامى الشهير على أن الرئيس محمد مرسى يستحق العقاب بالحبس لمدة ة تتراوح من ستة أشهر إلى سبع سنوات بسبب هروبه من السجن وطبقاٌ للقانون المصرى المعمول به حالياٌ , وأضاف أيضاٌ بأنه طبقاٌ للقانون الذى ينص على أنه لايجوز لأى شخص محبوس على ذمة قضية أخرى أن يقوم بالإدلاءء بشاهدته أمام أى محكمة فأنه لايجوز أن يطلب الرئيس مرسى الادلاء بشاهدته هو الأخر فى أى قضية نظرا لموقفه الحالى الغير قانونى .